Introducción: El conocimiento de las variables funcionales y morfológicas influyentes en la maduración de la deglución constituye la base científica para influir integralmente en el desarrollo adecuado del Sistema Estomatognático. Objetivo: Identificar las variables funcionales y morfológicas influyentes en la maduración de la deglución. Método: Se realizó un estudio descriptivo-longitudinal en 196 niños desde dos años y cuatro meses hasta tres años y seis meses de edad, de los Círculos infantiles atendidos en la Clínica Estomatológica «Victoria de Santa Clara», desde marzo 2018 hasta febrero de 2020. La muestra se seleccionó de forma no probabilística e intencional por criterios. Se utilizó una ficha y guías de observación para la recolección de los datos. Se aplicó el método estadístico descriptivo-inferencial, pruebas de independencia chi-cuadrado, el test exacto de Fisher, el test de McNemar para la asociación entre variables y la V de Cramer para la fortaleza. Se consideraron los aspectos éticos. Resultados: Al cabo de la segunda visita: prevaleció la deglución madura en 174 niños. En la madurez de la deglución predominó el cierre bilabial competente (171 niños), perfil convexo y relación anteroposterior normal (73 infantes respectivamente), presencia de diastemas, resalte y sobrepase funcional (174 niños en los tres aspectos). Se evidenció dependencia (p=0,000) entre la deglución con: respiración, masticación y fonación. Conclusiones: Las variables funcionales y morfológicas influyentes en la maduración de la deglución fueron: cierre bilabial competente, perfil convexo, relación anteroposterior normal, resalte y sobrepase funcional, presencia de diastemas, respiración nasal, masticación bilateral alternante y fonación adecuada.